作為國家級農業科研單位，生物技術研究所擁有生物學一級學科及生物化學與分子生物學、微生物學、生物信息學等3個二級學科博、碩士學位授權點和博士后流動站。在2017年全國第四輪評估中，中國農業科學院生物學科獲得“A-”的優異成績。
生物技術研究所現有博士研究生導師37人，碩士研究生導師35人，包括中國工程院院士1人，國家杰出青年科學基金獲得者2人，農業部“農業科研杰出人才及其創新團隊”入選者4名，國家有突出貢獻中青年專家3人，“百千萬人才工程”國家級人選7人, 科技部“中青年科技創新領軍人才”1人，國家優秀青年科學基金獲得者1人。截至2021年, 我所在讀研究生規模碩士94人、博士91人、留學生12人, 共培養博士畢業生153，碩士畢業生404人。
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